杉山・Badr研究室

モノクローナル抗体（mAb）の製造プロセス設計支援ツール構築を目指しています。ツールには以下の要素が組み込まれます。
・ 物理的モデルと統計モデルの組み合わせによる細胞培養のモデル化
・ 生産性と製品品質の面からのプロセス評価
・ 最適培養運転方式選択に向けたフレームワーク構築

Junu Kim, Kensaku Matsunami, Yusuke Ichida, Kozue Okamura, Sara Badr, Hirokazu Sugiyama
"Scenario analysis of vaccine supply for COVID-19 in Japan using mathematical models of infectious diseases"
Journal of Chemical Engineering of Japan, 57 (2024)
DOI: https://doi.org/10.1080/00219592.2024.2313318

Kozue Okamura, Hiroki Tsuchiya, Risa Hamada, Yusuke Hayashi, Sara Badr, Seiichi Ohta, Hirokazu Sugiyama
"A systems evaluation model for the development of companion diagnostics and associated molecularly targeted therapies"
Journal of Pharmaceutical Innovation, 199, 507–514 (2023)
DOI: https://doi.org/10.1007/s12247-023-09788-5

Kozue Okamura, Sara Badr, Sei Murakami, Hirokazu Sugiyama, "Hybrid Modeling of CHO Cell Cultivation in Monoclonal Antibody Production with an Impurity Generation Module" Industrial & Engineering Chemistry Research, 61, 14898–14909 (2022) DOI: 10.1021/acs.iecr.2c00736

Eri Amasawa, Hiroaki Kuroda, Kozue Okamura, Sara Badr, and Hirokazu Sugiyama, "Cost–Benefit Analysis of Monoclonal Antibody Cultivation Scenarios in Terms of Life Cycle Environmental Impact and Operating Cost" ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 9, 14012–14021 (2021) DOI: 10.1021/acssuschemeng.1c01435

Junu Kim, Kensaku Matsunami, Kozue Okamura, Sara Badr, Hirokazu Sugiyama, "Determination of critical decision points for COVID-19 measures in Japan" Scientific Reports, 11, 16416 (2021) DOI: 10.1038/s41598-021-95617-z

Sara Badr, Kozue Okamura, Nozomi Takahashi, Vera Ubbenjans, Haruku Shirahata, Hirokazu Sugiyama, "Integrated Design of Biopharmaceutical Manufacturing Processes: Operation Modes and Process Configurations for Monoclonal Antibody Production" Computers & Chemical Engineering, 153, 107422 (2021)
DOI: 10.1016/j.compchemeng.2021.107422

Kozue Okamura, Sara Badr, Akira Yamada, Hirokazu Sugiyama "Modeling and Dynamic Simulation of Cultivation in Monoclonal Antibody Production Considering Cell Metabolic Shifts", Oral, 2023 AIChE Annual Meeting, 5-10 November 2023, Hyatt Regency, Orlando, U.S.A.

岡村 梢, Badr Sara, 市田 侑亮, 山田 明, 杉山 弘和 "データ駆動型分析を用いたモノクローナル抗体製造における細胞培養のメカニスティックモデル構築", 口頭, 化学工学会 第54回秋季大会, 2023/9/11–13, 福岡大学 七隈キャンパス, 福岡県

岡村 梢, Badr Sara, 山田 明, 杉山 弘和 "モノクローナル抗体製造の培養プロセスにおける細胞代謝シフトのモデル化", 口頭, 化学工学会 第88年会, 2023/3/15–17, 東京農工大学 小金井キャンパス, 東京都

岡村 梢, 太田 誠一, 杉山 弘和 "コンパニオン診断の費用対効果分析のためのモデリング・アプローチ", 口頭, 化学工学会 第53回秋季大会, 2022/9/14–16, オンライン/信州大学 長野（工学）キャンパス, 長野県

Kozue Okamura, Sara Badr, Sei Murakami, Hirokazu Sugiyama "Hybrid modelling of CHO-MK cell cultivation in monoclonal antibody production", Oral, The 14th International Symposium on Process Systems Engineering (PSE 2021+), 19–23 June 2022, Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, Kyoto, Japan/Virtual meeting

岡村 梢*, 濵田 梨渚, 土屋 裕輝, 太田 誠一, 杉山 弘和 "コンパニオン診断の費用対効果モデリングと分析", 口頭, 化学工学会 第87年会, 2022/3/16–18, 神戸大学 鶴甲第1キャンパス、兵庫県 神戸市/オンライン

岡村 梢*, Badr Sara, 杉山 弘和 "モノクローナル抗体製造プロセスの統合設計に向けた細胞培養のハイブリッドモデリング" ポスター, 化学工学会第86年会, 2021年3月20日–22日, オンライン開催 優秀学生賞受賞

Kozue Okamura*, Sara Badr, Hirokazu Sugiyama "Simulation of cultivation processes in monoclonal antibody production towards the selection of operation modes" Oral, The 9th Asian Symposium on Process Systems Engineering (9th PSE Asia), 4–6 November 2020, Virtual meeting

岡村 梢*, Badr Sara, 杉山 弘和 "モノクローナル抗体製造における培養方式選択のためのプロセスシミュレーション" 要旨, 化学工学会第85年会

Kozue Okamura*, Sara Badr, Hirokazu Sugiyama "Dynamic simulation and process assessment of cultivation modes in monoclonal antibody production using pilot-scale experimental data", Oral, 2019 AIChE Annual Meeting, 10–15 November 2019, Hyatt Regency, Orlando, U.S.A.

岡村 梢* "バイオ医薬品の連続生産" 口頭, 2019年ISPE日本本部年次大会, 2019/5/30–31, タワーホール船堀, 東京都, 日本

岡村 梢*, Badr Sara, 杉山 弘和 "モノクローナル抗体製造における培養方式のダイナミックシミュレーションとプロセス評価" ポスター, 化学工学会第84年会, 2019/3/13–15, 芝浦工業大学, 東京都, 日本 優秀学生賞受賞

Sara Badr, Kota Oishi, Kozue Okamura, Sei Murakami, Hirokazu Sugiyama "Hybrid modelling and data-driven parameterization of monoclonal antibody cultivation processes: Shifts in cell metabolic behavior" Oral, The 33rd European Symposium on Computer-Aided Process Engineering (ESCAPE-33), 18–21 June 2023, Royal Olympic Hotel, Athens, Greece

吉山 有希, Badr Sara, 岡村 梢, 村上 聖, 杉山 弘和 "モノクローナル抗体製造における電荷異性体のデータ駆動型分析", 口頭, 化学工学会 第53回秋季大会, 2022/9/14–16, オンライン/信州大学 長野（工学）キャンパス, 長野県

Sara Badr, Kozue Okamura, Nozomi Takahashi, Hirokazu Sugiyama "Techno-economic assessment of upstream and downstream process alternatives for the production of monoclonal antibodies", Oral, The 14th International Symposium on Process Systems Engineering (PSE 2021+), 19–23 June 2022, Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, Kyoto, Japan/Virtual meeting

市田 侑亮, 松並 研作, Kim Junu, 岡村 梢, Badr Sara, 杉山 弘和 "感染症数理モデルを用いたCOVID-19のワクチン供給シナリオ分析", ポスター, 化学工学会 第87年会, 2022/3/16–18, 神戸大学 鶴甲第1キャンパス、兵庫県 神戸市/オンライン

天沢逸里*、黒田裕章, 岡村梢, BadrSara, 杉山弘和 "モノクローナル抗体製造による環境影響と健康効果の包括的評価"、第17回日本LCA学会研究発表会 2022/3/2/–4, オンライン開催

松並 研作*, 金 俊佑, 岡村 梢, 市田 侑亮, 松枝 俊虎, Badr Sara, 杉山 弘和 "モビリティ・治療薬・ワクチンの影響を考慮した感染症数理モデル" 口頭, 化学工学会第52回秋季大会, 2021年9月22日–24日, 岡山大学 津島キャンパス、岡山県 岡山市/オンライン開催

Max Berthet*, Kozue Okamura, Yang Li, Saeko Kawataki, Paul Nadeau "Student-Led Design of Online Tools to Support the Quality of Research Life at the University of Tokyo: A Survey-Based Approach" Oral, 9th European Conference on Education, 15–18 July 2021, Online

Badr Sara*, Okamura Kozue, Takahashi Nozomi, Sugiyama Hirokazu "Assessment of robustness and operational considerations for the design of integrated mAb manufacturing processes" 口頭, 化学工学会第86年会, 2021年3月20日–22日, オンライン開催

Sara Badr*, Kozue Okamura, Nozomi Takahashi, Hirokazu Sugiyama "Design of Integrated Monoclonal Antibody Production Processes: Modelling, Data, and Process Challenges" Oral, 2020 AIChE Annual Meeting, 16–20 November 2020, Virtual meeting

Sara Badr*, Kozue Okamura, Nozomi Takahashi, Vera Ubbenjans, Haruku Shirahata, Hirokazu Sugiyama "Integrated design of biopharmaceutical manufacturing processes: operation modes and process configurations for monoclonal antibody production" Oral, The 30th European Symposium on Computer-Aided Process Engineering (ESCAPE-30), 30 August–2 September 2020, Virtual meeting

Max Berthet*, Saeko Kawataki, Kozue Okamura, Mizuki Ishida, Karthik Varada "Understanding and Promoting Gender Diversity Among Senior Faculty at the University of Tokyo: A Student Action Project" Oral, 10th Asian Conference on Cultural Studies, 27–30 May 2020, Online

Sara Badr, Kota Oishi, Kozue Okamura, Sei Murakami, Hirokazu Sugiyama "Hybrid modelling and data-driven parameterization of monoclonal antibody cultivation processes: Shifts in cell metabolic behavior" Elsevier, Computer Aided Chemical Engineering, 52, 985–990 (2023)

Kozue Okamura, Sara Badr, Sei Murakami, Hirokazu Sugiyama "Hybrid modelling of CHO-MK cell cultivation in monoclonal antibody production" 14th International Symposium on Process System Engineering, Elsevier, Computer Aided Chemical Engineering, 49, 2137–2142 (2022)

Sara Badr, Kozue Okamura, Nozomi Takahashi, Hirokazu Sugiyama "Techno-economic assessment of upstream and downstream process alternatives for the production of monoclonal antibodies" 14th International Symposium on Process System Engineering, Elsevier, Computer Aided Chemical Engineering, 49, 745–750 (2022)

Sara Badr, Kozue Okamura, Nozomi Takahashi, Vera Ubbenjans, Haruku Shirahata, Hirokazu Sugiyama "Integrated design of biopharmaceutical manufacturing processes: operation modes and process configurations for monoclonal antibody production"Computer Aided Chemical Engineering, 48, 1609–1614 (2020)

杉山 弘和, 岡村 梢, Badr Sara "特集　次世代抗体医薬の実用化に向けた生産技術開発：抗体医薬品製造プロセスのハイブリッド・モデリング" 生物工学会誌, 101, 289–292 (2023)

岡村 梢, Badr Sara, 杉山 弘和 "Pharma PSE Spotlight 第18回：モノクローナル抗体製造における細胞培養プロセスのハイブリッドモデル" Pharm Tech Japan, 39, 467–471 (2023)

岡村 梢, Badr Sara, 杉山 弘和 "Pharma PSE Spotlight 第15回：バイオ医薬品製造における細胞培養プロセスのシミュレーションモデルと設計への応用" Pharm Tech Japan, 38, 1625–1629 (2022)

岡村 梢, 松並 研作, 白畑 春来, 杉山 弘和 "2019 AIChE Annual Meeting参加報告・紹介" Pharm Tech Japan, 36, 149–150 (2020)

岡村 梢　"人々の健康に貢献する、社会システムを創りたい。"　東大工学部【狂ATE the FUTURE】 (2021)

岡村 梢 "[学生会員の声] 面白さを開拓することの面白さ" 化学工学, 84(1), 43 (2020)